Domain List - domains found in dsRNA viruses

 

Domain# of viruses# of mammal proteins# of plant proteins# of DDI GO
pfam05518/Totivirus_coat15    
pfam02183/HALZ2 134 
pfam05878/Phyto_Pns9_103    
pfam00901/Orbi_VP57  1
pfam07236/Phytoreo_S73  1
pfam01767/Birna_VP37   
pfam07124/Phytoreo_P83  2
pfam09231/RDV-p33  3
pfam05880/Fiji_64_capsid4    
pfam07781/Reovirus_Mu24   
pfam04488/Gly_transf_sug330231 
pfam01700/Orbi_VP38  2
pfam02123/RdRP_485  1
pfam01525/Rota_NS262    
pfam04156/IncA1674   
pfam06016/Reovirus_L25  2
pfam01616/Orbi_NS37    
pfam06503/DUF11014    
pfam03569/Peptidase_C82    
pfam00680/RdRP_1275  1
pfam00434/VP72  2
pfam12072/DUF355212    
pfam00803/3A36    
pfam05838/DUF8478  1 
pfam08978/Reoviridae_Vp91  1 
pfam12039/DUF35252    
pfam00293/NUDIX722872905
pfam01518/PolyG_pol5   
pfam00769/ERM485 5
pfam01452/Rota_NSP41  1 
pfam01664/Reo_sigma11  2
pfam01665/Rota_NSP32  1
pfam00980/Rota_Capsid_VP62  2
pfam01766/Birna_VP27  1
pfam01660/Vmethyltransf210   
pfam05087/Rota_VP22  2
pfam03033/Glyco_transf_281 413
pfam00270/DEAD25615089879
pfam11602/NTPase_P44  1 
pfam06599/DUF11393    
pfam00035/dsrm393911103
pfam10482/CtIP_N136   
pfam05788/Orbi_VP18   
pfam00018/SH3_1327224718 
pfam06837/Fijivirus_P9-23    
pfam07407/Seadorna_VP63    
pfam08614/ATG16437 2 
pfam07653/SH3_232634406 
pfam05059/Orbi_VP47   
pfam06929/Rotavirus_VP33   
pfam00979/Reovirus_cap1  2
pfam00978/RdRP_2192   
pfam03042/Birna_VP55    
pfam07387/Seadorna_VP73    
pfam06705/SF-assemblin8 6  
pfam09220/LA-virus_coat2  1 
pfam06043/Reo_P93    
pfam00981/Rota_NS531   
pfam10464/Peptidase_U402    
pfam01768/Birna_VP47  1 
pfam07322/Seadorna_Vp103    
pfam05451/Phytoreo_Pns3    
pfam00426/VP42  1
pfam01718/Orbi_NS17    
pfam12289/Rotavirus_VP12  1 
pfam04514/BTV_NS25  1
pfam05903/DUF86263585  
pfam00897/Orbi_VP76  2
pfam05868/Rotavirus_VP71   
pfam01443/Viral_helicase1264  2
pfam01832/Glucosaminidase45   
pfam01464/SLT97 15  
pfam05865/Cypo_polyhedrin1    
pfam02509/Rota_NS352   
pfam05993/Reovirus_M25  4
pfam04866/Rota_NS61    
pfam00898/Orbi_VP23   
pfam03084/Sigma_1_25  3 
pfam07925/RdRP_55   
pfam01830/Peptidase_C72   
pfam00261/Tropomyosin12282 3 
pfam04582/Reo_sigmaC4  1 
pfam04197/Birna_RdRp7   
pfam09374/PG_binding_38  2 
pfam01516/Orbi_VP65   


 
abbr.
* DDI: Domain-Domain-Interaction
* GO: Gene Ontology

 
0